18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_26390  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  100 
 
 
419 aa  838    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.391962  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26490  glycosyl/glycerophosphate transferase, teichoic acid biosynthesis  36.95 
 
 
586 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26400  hypothetical protein  36.14 
 
 
576 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.966335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5666  hypothetical protein  33.33 
 
 
569 aa  136  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1350  hypothetical protein  32.72 
 
 
608 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.746878  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1678  hypothetical protein  31.68 
 
 
564 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193325  normal  0.353348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1844  hypothetical protein  29.64 
 
 
581 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.225555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1683  hypothetical protein  34.86 
 
 
564 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5667  hypothetical protein  29.65 
 
 
551 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1843  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.27 
 
 
588 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.426283 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02775  hypothetical protein  27.48 
 
 
438 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000201247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02826  hypothetical protein  27.48 
 
 
458 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02771  hypothetical protein  24.87 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000264009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02821  hypothetical protein  24.87 
 
 
379 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000136217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1435  hypothetical protein  22.35 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2416  hypothetical protein  28.95 
 
 
407 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.256887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2590  CDP-glycerol:poly-glycerophosphate transferase  23.32 
 
 
571 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4514  hypothetical protein  28.49 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.11129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>