24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24220  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  209  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1208  hypothetical protein  35.87 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3081  hypothetical protein  34.91 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2700  hypothetical protein  35.78 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07240  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.676823  normal  0.326272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1101  hypothetical protein  34.82 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121424  normal  0.0518739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0448  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5015  hypothetical protein  34.82 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0576  hypothetical protein  40.23 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3287  hypothetical protein  37.76 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0636  hypothetical protein  37.18 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00923819  hitchhiker  0.000274173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4540  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3250  hypothetical protein  41.58 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.219579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8074  hypothetical protein  31.34 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0452  hypothetical protein  29.63 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2352  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1705  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0525  hypothetical protein  33.91 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4427  hypothetical protein  31 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02990  hypothetical protein  36.11 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17930  hypothetical protein  41 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0514  hypothetical protein  25.81 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6116  hypothetical protein  23.39 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550687  normal  0.46326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>