30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06690 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  237  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  52.94 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  38.68 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  36.9 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  39.13 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.53 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  37.14 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.48 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.03 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  37.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  37.18 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  42.03 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  36.11 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  42.03 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  31.25 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  42.03 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.25 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  35.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  36.19 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  42.03 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  37.68 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  37.68 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  37.68 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 		 111 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  37.18 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  32.93 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>