44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00210 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00210    100 
 
 		 1185 bp  2349    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0564  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  87.5 
 
 		 1776 bp  71.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.499479  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3172  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  88.06 
 
 		 1767 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0724  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  88.06 
 
 		 1767 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.656695  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2874  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  88.06 
 
 		 1767 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.463572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0142  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  88.06 
 
 		 1767 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.823493  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1446  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  88.06 
 
 		 1767 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0538  pts system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  88.06 
 
 		 1761 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0555  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  88.06 
 
 		 1761 bp  69.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0238    85.71 
 
 		 1393 bp  65.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1357  putative phosphotransferase system protein  84.27 
 
 		 1710 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15780  PTS system N-acetylglucosamine-specific IIBC component  95.12 
 
 		 1713 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000797276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4152  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  86.11 
 
 		 1788 bp  63.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0482  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  86.57 
 
 		 1791 bp  61.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.668404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1423  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  89.09 
 
 		 1341 bp  61.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.10018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2832  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  86.36 
 
 		 1770 bp  60  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2739  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  86.36 
 
 		 1764 bp  60  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6151  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  86.36 
 
 		 1770 bp  60  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8111  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  87.1 
 
 		 1320 bp  60  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.75222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0958  PTS system, glucose-like IIB subunint  96.97 
 
 		 1914 bp  58  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.682215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1003  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  92.68 
 
 		 1719 bp  58  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0795  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  100 
 
 		 1236 bp  56  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0450  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIABC component  83.33 
 
 		 1770 bp  56  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.286084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3019  PTS system, glucose-like IIB subunint  90.7 
 
 		 1581 bp  54  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0295  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC subunit  89.13 
 
 		 1806 bp  52  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0308  PTS system, glucose-like IIB subunint  87.04 
 
 		 1977 bp  52  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16900  glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific phosphotransferase system IIC component  92.11 
 
 		 1293 bp  52  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2412  PTS system, N-acetylglucosamine-specific IIBC component  84.85 
 
 		 1689 bp  52  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1422  Protein-N(pi)-phosphohistidine-- sugarphosphotran sferase  83.56 
 
 		 1335 bp  50.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0997285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3734  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  81.72 
 
 		 1479 bp  50.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01105  hypothetical protein  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0824942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2784  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  96.43 
 
 		 1419 bp  48.1  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327338 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1480  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000807598  hitchhiker  0.0000000861418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2026  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000829082  hitchhiker  0.00000105555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2500  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  unclonable  0.0000000187594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1222  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000545559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1223  PTS system glucose-specific transporter subunits IIBC  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000478897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1358  PTS system glucose-glucoside family transporter subunit EIIA/phosphocarrier Hpr/phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  85.71 
 
 		 2526 bp  48.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  93.75 
 
 		 1977 bp  48.1  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5958  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 1839 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5555  AAA ATPase, central region  100 
 
 		 1839 bp  48.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0347  Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  91.67 
 
 		 750 bp  48.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2546  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000966269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01097  fused glucose-specific PTS enzymes: IIB component/IIC component  93.75 
 
 		 1434 bp  48.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0550337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>