93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6045 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  90.38 
 
 		 414 aa  764    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 416 aa  842    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  84.93 
 
 		 419 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  77.4 
 
 		 413 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 416 aa  842    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  77.4 
 
 		 414 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  84.45 
 
 		 419 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  95.67 
 
 		 416 aa  811    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  77.88 
 
 		 414 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  62.62 
 
 		 413 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  55.21 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  48.32 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  48.07 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  47.7 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  46.51 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  45.74 
 
 		 393 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  45.3 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  46.23 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  43.37 
 
 		 389 aa  329  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  43.1 
 
 		 394 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  46.75 
 
 		 394 aa  322  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  43.52 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  41.85 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  43.14 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  43.88 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  41.15 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  43.13 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  41.2 
 
 		 419 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  40 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  40.63 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  41.93 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  42.72 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  41.81 
 
 		 420 aa  265  8e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  40.72 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  40.72 
 
 		 419 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  40.91 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 		 421 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  42.2 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  42.37 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  37.56 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  39.76 
 
 		 404 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.35 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  36.34 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.1 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  34.57 
 
 		 502 aa  200  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  38.24 
 
 		 398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.03 
 
 		 389 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.44 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 		 430 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  36.22 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  37.53 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  35.75 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.5 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  29.3 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.18 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  30.89 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  27.29 
 
 		 1506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  25.24 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  32.77 
 
 		 382 aa  90.5  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  30.8 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  36.99 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  32.41 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  35.62 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  27.92 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  29.32 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  28.77 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  27.57 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  29.79 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  31.05 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  30.48 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  25.44 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  28.46 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  33.93 
 
 		 340 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  28.97 
 
 		 324 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  27.7 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  25.66 
 
 		 352 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 		 352 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 		 352 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  28.36 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  32.69 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  22.28 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  27.4 
 
 		 353 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25.89 
 
 		 384 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  32.47 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  23.13 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  24.06 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  25.85 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  22.75 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  22.75 
 
 		 351 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>