40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0075 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  73.04 
 
 
204 aa  284  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  70.5 
 
 
200 aa  278  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  74.36 
 
 
198 aa  260  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  61.26 
 
 
195 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  43.62 
 
 
190 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  36.55 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  30.14 
 
 
291 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  24.21 
 
 
196 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  23.67 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  24.26 
 
 
207 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  42.17 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.89 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  34.34 
 
 
311 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 
200 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 
240 aa  44.7  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 
447 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  21.55 
 
 
447 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.23 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 
194 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.5 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.5 
 
 
200 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
448 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
448 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  22.4 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
218 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>