19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0012 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  69.04 
 
 		 375 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  55.9 
 
 		 372 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  52.23 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  48.18 
 
 		 380 aa  355  5e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  44.44 
 
 		 361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  46.57 
 
 		 380 aa  324  1e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  45.51 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  45.87 
 
 		 370 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  42.27 
 
 		 364 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  39.09 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  44.81 
 
 		 249 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  28.85 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  28.06 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  28.06 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  23.45 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  23.51 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  20.13 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  21.8 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0189337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>