47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3887 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2889  putative lipoprotein  100 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0107  putative lipoprotein  100 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3968  putative lipoprotein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3887  putative lipoprotein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.488572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3465  putative lipoprotein  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3084  putative lipoprotein  99.55 
 
 
224 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1653  putative lipoprotein  99.55 
 
 
224 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3204  putative lipoprotein  95.98 
 
 
224 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3022  hypothetical protein  72.32 
 
 
224 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2389  hypothetical protein  72.32 
 
 
224 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3003  hypothetical protein  72.32 
 
 
224 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2997  hypothetical protein  71.88 
 
 
224 aa  344  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657321  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2912  hypothetical protein  67.86 
 
 
221 aa  301  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21812  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01774  lipoprotein  63.13 
 
 
223 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0155892  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1339  putative lipoprotein  62.8 
 
 
218 aa  259  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2721  putative lipoprotein  62.8 
 
 
218 aa  258  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1451  hypothetical protein  62.8 
 
 
218 aa  258  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0050  putative lipoprotein  58.8 
 
 
221 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.99075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4281  hypothetical protein  60.39 
 
 
219 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1252  lipoprotein, putative  58.37 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4602  protein of unknown function DUF799  58.45 
 
 
219 aa  241  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5337  hypothetical protein  55.35 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232153  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4223  protein of unknown function DUF799  57.99 
 
 
219 aa  234  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1455  hypothetical protein  55.9 
 
 
225 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4014  protein of unknown function DUF799  56.62 
 
 
219 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.741538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3429  hypothetical protein  52.34 
 
 
224 aa  221  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2761  protein of unknown function DUF799  53.14 
 
 
224 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.936694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3560  hypothetical protein  50.93 
 
 
221 aa  216  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00590  putative lipoprotein  59.88 
 
 
169 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.592522  normal  0.156495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1388  hypothetical protein  51.66 
 
 
219 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5409  hypothetical protein  49.51 
 
 
220 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0882  glycosyltransferase  44.13 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1129  lipoprotein  39.45 
 
 
225 aa  148  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0269959  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1495  lipoprotein  40.1 
 
 
224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.196072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0394  putative lipoprotein  33 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0423  protein of unknown function DUF799  33 
 
 
224 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0422  protein of unknown function DUF799  32.02 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4118  hypothetical protein  29.17 
 
 
230 aa  88.2  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1766  hypothetical protein  29.1 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12485  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05523  hypothetical protein  29.7 
 
 
214 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4671  hypothetical protein  29.78 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195271  normal  0.101554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3789  hypothetical protein  28 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00728655  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3264  lipoprotein, putative  24.71 
 
 
189 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1992  hypothetical protein  23.94 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.580789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3071  putative lipoprotein  23.6 
 
 
195 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3169  lipoprotein, putative  27.27 
 
 
191 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1833  putative lipoprotein  25.83 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>