24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6442 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6442  hydroxyneurosporene synthase  100 
 
 		 404 aa  803    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1288  hydroxyneurosporene synthase  58.1 
 
 		 319 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1705  hydroxyneurosporene synthase  55.1 
 
 		 317 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4006  hydroxyneurosporene synthase  54.14 
 
 		 317 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3761  hydroxyneurosporene synthase  53.5 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3692  hydroxyneurosporene synthase  56.52 
 
 		 297 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2952  hydroxyneurosporene synthase  51.67 
 
 		 299 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2725  hydroxyneurosporene synthase  51.67 
 
 		 300 aa  293  5e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2047  hydroxyneurosporene synthase  52.75 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.329916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2823  hydroxyneurosporene synthase  50.52 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.467897  normal  0.293634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2847  hydroxyneurosporene synthase  50.87 
 
 		 286 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.724787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1615  hydroxyneurosporene synthase  48.33 
 
 		 275 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2985  hydroxyneurosporene synthase  46.64 
 
 		 253 aa  222  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.813569  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1911  hydroxyneurosporene synthase  40.21 
 
 		 279 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2041  hydroxyneurosporene synthase  40.21 
 
 		 281 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.42927 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0267  hydroxyneurosporene synthase  40.21 
 
 		 279 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3512  hydroxyneurosporene dehydrogenase  40.82 
 
 		 252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.411163  normal  0.914235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0184  hydroxyneurosporene synthase  35.59 
 
 		 240 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0428  hydroxyneurosporene synthase  21.57 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000692548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0360  hydroxyneurosporene synthase  20.2 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0314991  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0393  hydroxyneurosporene synthase CrtC  24.62 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1988  hydroxyneurosporene synthase  24.21 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0180674  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0465  hydroxyneurosporene synthase  20.65 
 
 		 376 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1781  hydroxyneurosporene synthase  21.57 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0186399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>