69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2525 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  57.06 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  54.65 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  54.73 
 
 		 344 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.45 
 
 		 348 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.7 
 
 		 348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  44.94 
 
 		 347 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.13 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.85 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.85 
 
 		 354 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  45.48 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  43.95 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  43.27 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.29 
 
 		 358 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.71 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.41 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  39.27 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  36.66 
 
 		 352 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  36.72 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  36.31 
 
 		 355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.88 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  33.92 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  37.22 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.54 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  30 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08170  sulfate ester transport system substrate-binding protein  36.67 
 
 		 350 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  30 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1912  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  26.82 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.72 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  30 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  29.17 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  30 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  21.28 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08130  ABC transporter, sulfate ester binding protein  30.28 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  31.53 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  29.17 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  31.53 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.83 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  28.33 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  27.52 
 
 		 337 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  28.33 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6519  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  23.86 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6753  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.86 
 
 		 330 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0691662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.91 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4036  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.63 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  20.69 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6342  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.14 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.55 
 
 		 340 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5004  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0232  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 345 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  30.41 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4844  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  22.67 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.733811  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1354  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  34.17 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  30 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2623  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.72 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  30.1 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1433  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  29.93 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1833  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  32.5 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97335  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4540  NMT1/THI5 like domain protein  24.75 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184718 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  28.46 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.62 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2584  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7198  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  21.96 
 
 		 357 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2629  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.43 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.178232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  21.95 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.62 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.62 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.21 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>