45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3347 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  64.37 
 
 		 354 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.7 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.7 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.7 
 
 		 348 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.45 
 
 		 354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  41.11 
 
 		 344 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.57 
 
 		 358 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.45 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  41.79 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  43.27 
 
 		 360 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  44.35 
 
 		 344 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.15 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.86 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  40.11 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.57 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  35.88 
 
 		 354 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  37.35 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  34.66 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  35.71 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  35.4 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.07 
 
 		 344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  28.61 
 
 		 319 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  31.27 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.24 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4066  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  22.91 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.99 
 
 		 374 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0481  NMT1/THI5 like domain protein  20.96 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1354  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  22.22 
 
 		 360 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08170  sulfate ester transport system substrate-binding protein  32.23 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2224  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  22.06 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000455762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  21.92 
 
 		 364 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1433  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  32.35 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0026  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  20.66 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.778935  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  27.21 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0032  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  20.36 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.420208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1833  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  33.9 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0211  sulfate ester transport system substrate-binding protein  30.84 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.887162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2507  ABC transporter substrate-binding protein  35.96 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  25.52 
 
 		 335 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.34 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.21 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03760  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonate  23.57 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>