65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2602 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3536  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  94.63 
 
 
354 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0480036  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2602  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  100 
 
 
358 aa  711    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3983  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  94.92 
 
 
354 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.156548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2608  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  58.26 
 
 
358 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3530  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.68 
 
 
358 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.033604  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3989  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  57.39 
 
 
358 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2606  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.22 
 
 
348 aa  354  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.35467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3987  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.63 
 
 
348 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106064 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3532  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  54.63 
 
 
348 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.304569  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1550  hypothetical protein  47.78 
 
 
347 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00115977  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5652  hypothetical protein  48.57 
 
 
344 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.777199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3346  hypothetical protein  47.09 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7180  desulfurizing enzyme  45.4 
 
 
344 aa  302  6.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.857064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2525  hypothetical protein  46.13 
 
 
360 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5654  hypothetical protein  44.15 
 
 
346 aa  299  6e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0147  putative desulfurizing enzyme  44.64 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.975202  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3347  hypothetical protein  44.57 
 
 
352 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3341  hypothetical protein  41.3 
 
 
353 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1565  monooxygenase, putative  39.42 
 
 
352 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.519738  hitchhiker  0.000170358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1546  hypothetical protein  36.73 
 
 
355 aa  219  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.062934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7801  hypothetical protein  41.23 
 
 
368 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3816  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.46 
 
 
344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.442978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1391  hypothetical protein  36.31 
 
 
319 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000110401  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1041  desulfurizing enzyme  38.85 
 
 
302 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.460145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0145  NMT1/THI5 like domain protein  25 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3886  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  22.09 
 
 
374 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4330  NMT1/THI5 like domain protein  24.68 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.688917  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08130  ABC transporter, sulfate ester binding protein  24.06 
 
 
313 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1743  nitrogenase cofactor biosynthesis protein NifB  21.79 
 
 
306 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00139756  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0134  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.71 
 
 
366 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0147618  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7236  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  35.92 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.82896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1573  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 
326 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.817202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  22.14 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  22.14 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2967  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  24.46 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2713  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.14 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.38086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2921  sulfonate ABC transporter sulfonate-binding protein  22.14 
 
 
328 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3874  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.22 
 
 
343 aa  49.7  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1912  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  24.16 
 
 
367 aa  49.7  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2641  alkanesulfonates-binding protein  23.74 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.245447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02360  putative binding protein component of ABC transporter  28.12 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000681113  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0267  sulfate ester transport system substrate-binding protein  28.12 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173265  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1833  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  30.97 
 
 
376 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.97335  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4562  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.06 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.451488  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2061  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.78 
 
 
355 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0563567  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4022  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.03 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4344  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.03 
 
 
374 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.252386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2623  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  32.74 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226045  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08170  sulfate ester transport system substrate-binding protein  31.86 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3502  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.03 
 
 
355 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0829202  decreased coverage  0.000183537 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2160  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  38.04 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.486423  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1433  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  30.09 
 
 
381 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748329  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7220  ABC transporter substrate binding protein (aliphatic sulfonate)  29.5 
 
 
322 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.74 
 
 
328 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2096  ABC sulfate ester transporter, periplasmic ligand binding protein  36.96 
 
 
355 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.522896  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1999  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.37 
 
 
331 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2664  alkanesulfonates-binding protein  23.02 
 
 
328 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.16 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0251  putative sulfonate binding protein precursor  24.1 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.08 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3641  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  21.49 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000105087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2931  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  23.68 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1354  putative sulfate ester transporter, periplasmic binding component  28.38 
 
 
360 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2638  putative sulfate ester binding protein  28.12 
 
 
345 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0400  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  25.32 
 
 
316 aa  43.1  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.882612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>