More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1461 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
347 aa  689  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  3.97491e-10  unclonable  2.42005e-07 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  95.82 
 
 
335 aa  636  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  84.06 
 
 
345 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  80 
 
 
345 aa  551  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  78.96 
 
 
344 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  5.50029e-06  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  79.77 
 
 
352 aa  541  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  78.13 
 
 
349 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.01977e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  79.58 
 
 
335 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  72.78 
 
 
350 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  74.48 
 
 
350 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  73.29 
 
 
424 aa  493  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  73.29 
 
 
350 aa  491  1e-138  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  72.7 
 
 
350 aa  492  1e-138  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  73.29 
 
 
350 aa  492  1e-138  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  72.4 
 
 
350 aa  490  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  71.3 
 
 
350 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  71.3 
 
 
350 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  71.22 
 
 
360 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  62.57 
 
 
342 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  62.28 
 
 
342 aa  421  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  63.25 
 
 
343 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  61.7 
 
 
339 aa  417  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.59245e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  61.03 
 
 
346 aa  416  1e-115  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.02365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  60.7 
 
 
343 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  62.94 
 
 
344 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  61.29 
 
 
343 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  6.77131e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  59.13 
 
 
343 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  60.54 
 
 
343 aa  408  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  59.36 
 
 
347 aa  405  1e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.97933e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 
347 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 
343 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.65 
 
 
347 aa  401  1e-110  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.83454e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 
344 aa  398  1e-110  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  59.46 
 
 
344 aa  398  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  60.42 
 
 
368 aa  401  1e-110  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 
343 aa  400  1e-110  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  58.72 
 
 
342 aa  399  1e-110  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  59.46 
 
 
344 aa  398  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.47 
 
 
350 aa  400  1e-110  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.1 
 
 
344 aa  399  1e-110  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  57.8 
 
 
348 aa  399  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.35004e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  57.94 
 
 
340 aa  398  1e-110  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 
342 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  59.46 
 
 
344 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 
344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 
344 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  57.99 
 
 
344 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  62.35 
 
 
343 aa  395  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  57.52 
 
 
343 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  4.55643e-09 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  56.76 
 
 
345 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.77 
 
 
347 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  57.89 
 
 
347 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.81914e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.77 
 
 
347 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  7.07423e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  59.16 
 
 
344 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 
340 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  58.13 
 
 
343 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  57.73 
 
 
346 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  58.31 
 
 
346 aa  391  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  56.6 
 
 
354 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  55.85 
 
 
346 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  59.57 
 
 
338 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  59.82 
 
 
339 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  60.78 
 
 
346 aa  388  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  58.97 
 
 
349 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 
342 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  55.82 
 
 
343 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.44 
 
 
336 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  59.09 
 
 
340 aa  385  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.87033e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.18 
 
 
344 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 
346 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  57.56 
 
 
343 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.72 
 
 
344 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  58.04 
 
 
348 aa  383  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  5.73376e-09 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 
346 aa  381  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  58.26 
 
 
366 aa  378  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  378  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.32 
 
 
344 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  58.02 
 
 
338 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  56.23 
 
 
347 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  6.6828e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 
340 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 
342 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  56.17 
 
 
345 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  56.69 
 
 
345 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 
339 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 
347 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.22229e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  58.02 
 
 
344 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  55.93 
 
 
343 aa  371  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  54.68 
 
 
346 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  54.41 
 
 
344 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 
346 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  54.97 
 
 
348 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.8278e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  56.21 
 
 
339 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>