34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2177 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2177  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
264 aa  521  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.494459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1697  transcriptional repressor CodY  47.84 
 
 
250 aa  214  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00224201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2721  transcriptional repressor CodY  43.89 
 
 
255 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000105427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07580  transcriptional repressor CodY  43.61 
 
 
260 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1955  transcriptional repressor CodY  43.02 
 
 
258 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00079706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1673  transcriptional repressor CodY  43.02 
 
 
258 aa  201  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000117412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1228  transcriptional repressor CodY  43.18 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000144432  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1031  transcriptional repressor CodY  41.15 
 
 
262 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000437393  unclonable  0.0000000093058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1979  transcriptional repressor CodY  39.85 
 
 
261 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000233439  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1386  transcriptional repressor CodY  41.92 
 
 
261 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062677  normal  0.893187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3711  transcriptional repressor CodY  40.6 
 
 
262 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3966  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000207979  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3840  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.06585e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3587  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000152873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3569  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.9638199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3679  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000500442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3875  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000053796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1317  transcriptional repressor CodY  42.69 
 
 
259 aa  188  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000604524  hitchhiker  6.27624e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3926  transcriptional repressor CodY  42.69 
 
 
259 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2480  transcriptional repressor CodY  42.75 
 
 
259 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000457374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3651  transcriptional repressor CodY  43.24 
 
 
259 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3869  transcriptional repressor CodY  42.69 
 
 
259 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1340  transcriptional repressor CodY  40.38 
 
 
257 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000548296  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1315  transcriptional repressor CodY  40.38 
 
 
257 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000018867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0845  transcriptional repressor CodY  40.45 
 
 
262 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1107  transcriptional repressor CodY  41.76 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1999  transcriptional repressor CodY  42.15 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1675  transcriptional repressor CodY  42.37 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0821  transcriptional repressor CodY  38.66 
 
 
256 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298732  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0605  transcriptional repressor CodY  37.98 
 
 
259 aa  175  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244841  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1341  GTP-sensing pleiotropic transcriptional repressor CodY  37.69 
 
 
276 aa  168  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000508255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1599  transcriptional repressor CodY  39.15 
 
 
261 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00104108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  37.74 
 
 
262 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000303115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2378  transcriptional repressor CodY  33.46 
 
 
262 aa  155  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000594267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>