35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3679 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3840  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.06585e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3679  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000500442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3569  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.9638199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3587  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000152873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3966  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000207979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3875  transcriptional repressor CodY  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000053796  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3869  transcriptional repressor CodY  99.61 
 
 
259 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000736114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1317  transcriptional repressor CodY  99.23 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000604524  hitchhiker  6.27624e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3926  transcriptional repressor CodY  99.23 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2480  transcriptional repressor CodY  97.68 
 
 
259 aa  490  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000457374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3651  transcriptional repressor CodY  97.3 
 
 
259 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1107  transcriptional repressor CodY  85.71 
 
 
259 aa  428  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1999  transcriptional repressor CodY  84.94 
 
 
259 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0821  transcriptional repressor CodY  63.53 
 
 
256 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1315  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
257 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000018867  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1340  transcriptional repressor CodY  63.04 
 
 
257 aa  330  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000548296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07580  transcriptional repressor CodY  61.09 
 
 
260 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1673  transcriptional repressor CodY  58.59 
 
 
258 aa  304  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000117412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1955  transcriptional repressor CodY  58.59 
 
 
258 aa  304  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00079706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1031  transcriptional repressor CodY  57.81 
 
 
262 aa  299  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000437393  unclonable  0.0000000093058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1386  transcriptional repressor CodY  62.99 
 
 
261 aa  298  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062677  normal  0.893187 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1979  transcriptional repressor CodY  57.75 
 
 
261 aa  297  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000233439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1228  transcriptional repressor CodY  57.81 
 
 
261 aa  296  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000144432  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3711  transcriptional repressor CodY  58.91 
 
 
262 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.207426  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1697  transcriptional repressor CodY  61.57 
 
 
250 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00224201  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0605  transcriptional repressor CodY  51.36 
 
 
259 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0845  transcriptional repressor CodY  52.16 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1599  transcriptional repressor CodY  48.43 
 
 
261 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00104108  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1675  transcriptional repressor CodY  48.82 
 
 
261 aa  248  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0168  transcriptional repressor CodY  46.27 
 
 
262 aa  240  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000303115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1341  GTP-sensing pleiotropic transcriptional repressor CodY  49.81 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000508255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2721  transcriptional repressor CodY  49.44 
 
 
255 aa  218  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000105427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2378  transcriptional repressor CodY  42 
 
 
262 aa  201  8e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000594267  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2177  transcriptional repressor CodY  43.08 
 
 
264 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.494459  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1982  pleiotropic transcriptional repressor  24.88 
 
 
199 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>