56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0873 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  77.78 
 
 
144 aa  244  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  57.75 
 
 
174 aa  179  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  49.25 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  45.45 
 
 
140 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  43.48 
 
 
151 aa  119  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.78 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  43.51 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.51 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.51 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  39.69 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  39.69 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  39.69 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.7 
 
 
140 aa  104  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.62 
 
 
154 aa  102  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  38.58 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40 
 
 
155 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  36.43 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  39.06 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  39.37 
 
 
185 aa  92  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  39.2 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.6 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  43.09 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  37.4 
 
 
142 aa  77  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  33.33 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 
147 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  34.06 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  32.82 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  32.58 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  36.13 
 
 
177 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  33.61 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  32.06 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  32.52 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.79 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  33.83 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  32.54 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  29.84 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  29.93 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  33.08 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  32 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  32.58 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.81 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  32.03 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  30.89 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.76 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  25.81 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  34.11 
 
 
155 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  24.63 
 
 
190 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  25.38 
 
 
146 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3548  hypothetical protein  30.49 
 
 
142 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1820  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.95 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>