44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0079 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
327 aa  669  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  55.18 
 
 
335 aa  356  2e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  53.89 
 
 
325 aa  349  3e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  52.04 
 
 
336 aa  342  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  52.96 
 
 
326 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  52.96 
 
 
326 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  53.14 
 
 
324 aa  321  8e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  51.9 
 
 
331 aa  311  8e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.6799e-06  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  47.85 
 
 
326 aa  309  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  46.77 
 
 
325 aa  309  5e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  50.15 
 
 
317 aa  307  2e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  47.42 
 
 
353 aa  306  4e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  46.73 
 
 
346 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.26066e-05 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  47.08 
 
 
331 aa  289  5e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  45.29 
 
 
346 aa  282  5e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  45.29 
 
 
346 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  44.72 
 
 
334 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.66 
 
 
336 aa  130  4e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  29.48 
 
 
336 aa  129  7e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  28.66 
 
 
336 aa  129  9e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  28.7 
 
 
348 aa  127  2e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.08 
 
 
355 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.62 
 
 
329 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  24.04 
 
 
304 aa  73.6  5e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.96 
 
 
299 aa  72.8  7e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.68 
 
 
295 aa  72  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  26.1 
 
 
295 aa  71.6  2e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.1 
 
 
295 aa  71.6  2e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  26.1 
 
 
295 aa  71.6  2e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.36 
 
 
289 aa  70.9  3e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  22.26 
 
 
300 aa  70.1  5e-11  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  23.57 
 
 
296 aa  69.7  6e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  24.84 
 
 
292 aa  66.2  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  24.84 
 
 
292 aa  66.2  8e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  24.53 
 
 
292 aa  64.7  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  24.53 
 
 
292 aa  65.1  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  24.53 
 
 
292 aa  65.1  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  24.91 
 
 
292 aa  60.5  4e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  24.91 
 
 
292 aa  59.7  6e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  24.91 
 
 
292 aa  59.7  6e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.91 
 
 
292 aa  59.7  6e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  24.91 
 
 
292 aa  59.7  6e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  24.91 
 
 
292 aa  59.3  8e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.45 
 
 
294 aa  58.2  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>