45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5328 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 
292 aa  597  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  99.66 
 
 
292 aa  594  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  99.32 
 
 
292 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  99.32 
 
 
292 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  99.32 
 
 
292 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  99.32 
 
 
292 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 
292 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 
292 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 
292 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 
292 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  87.67 
 
 
292 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
295 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  66.67 
 
 
295 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  66.67 
 
 
295 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  65.51 
 
 
295 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  48.63 
 
 
294 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  43.93 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  29.25 
 
 
336 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  28.85 
 
 
336 aa  102  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
348 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.27 
 
 
336 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  25.33 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.71 
 
 
355 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.71 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  23.15 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.9 
 
 
335 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.08 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.71 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  26.96 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.7 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.51 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.91 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  24.92 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.09 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.09 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  22.58 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  24.56 
 
 
353 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.1 
 
 
329 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.32 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.43 
 
 
327 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.78 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.47 
 
 
346 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.65 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.84 
 
 
346 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>