45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4030 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  100 
 
 
289 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  61.11 
 
 
294 aa  333  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  49.47 
 
 
295 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.47 
 
 
295 aa  253  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  49.47 
 
 
295 aa  253  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  52.3 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  46.57 
 
 
292 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  46.57 
 
 
292 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  46.21 
 
 
292 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  46.21 
 
 
292 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  46.21 
 
 
292 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  43.21 
 
 
292 aa  227  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  43.21 
 
 
292 aa  225  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.584894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  43.21 
 
 
292 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  43.21 
 
 
292 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  43.21 
 
 
292 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  43.21 
 
 
292 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.56 
 
 
336 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  30.36 
 
 
336 aa  122  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  30.36 
 
 
336 aa  120  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.67 
 
 
331 aa  92.8  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.96 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  27.61 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  28.31 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.47 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.96 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  29.07 
 
 
335 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.38 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  28.72 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.06 
 
 
346 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  29.73 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.11 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.16 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.57 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.24 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  27.84 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.24 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  28.32 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.35 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.36 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.86 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.92 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.16 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
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NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  27.42 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.494769 
 
 
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