45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4410 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4410  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4232  deoxyribose-phosphate aldolase  100 
 
 		 292 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4254  deoxyribose-phosphate aldolase  98.97 
 
 		 292 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4345  deoxyribose-phosphate aldolase  99.32 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4299  deoxyribose-phosphate aldolase  99.32 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4266  deoxyribose-phosphate aldolase  88.36 
 
 		 292 aa  519  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4105  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  88.01 
 
 		 292 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03715  hypothetical protein  88.01 
 
 		 292 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5328  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 		 292 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.584894 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4404  deoxyribose-phosphate aldolase  88.01 
 
 		 292 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03766  predicted aldolase  88.01 
 
 		 292 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4351  deoxyribose-phosphate aldolase  67.01 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4138  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  67.01 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.302553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4105  deoxyribose-phosphate aldolase  67.01 
 
 		 295 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1043  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  66.9 
 
 		 295 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1948  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.32 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.493556  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4030  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  46.57 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1127  tagatose 1,6-diphosphate aldolase-like protein  27.87 
 
 		 336 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1345  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  27.53 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1156  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.91 
 
 		 336 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2597  tagatose-bisphosphate aldolase  30.03 
 
 		 348 aa  96.3  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.102092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3974  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  25.9 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00258196  normal  0.0292839 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2454  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.05 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.214558  normal  0.936143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5337  aldolase  25.69 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0798  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.26 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0145  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.86 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000016799  normal  0.130551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2111  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.88 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1950  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.42 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.524576  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1146  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.1 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0514012  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2223  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.44 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2262  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.44 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0758  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.57 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D03  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.44 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000270283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3960  Tagatose-bisphosphate aldolase  25.89 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2246  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.17 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.101189  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1020  Tagatose-bisphosphate aldolase  29.35 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.494769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1238  Tagatose-bisphosphate aldolase  24.68 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1792  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.67 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.696246  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0139  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.49 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0079  Tagatose-bisphosphate aldolase  24.84 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3347  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  24.62 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2514  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  26.13 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1928  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.26 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1830  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  25.48 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1612  tagatose 1,6-diphosphate aldolase  23.88 
 
 		 331 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>