More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1363 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
266 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  63.89 
 
 
348 aa  329  2e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  61.51 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  60.87 
 
 
294 aa  322  4e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  60.82 
 
 
249 aa  315  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.09 
 
 
257 aa  307  9e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  58.47 
 
 
258 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.28 
 
 
253 aa  305  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.89 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.97 
 
 
253 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  54.88 
 
 
256 aa  300  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.78 
 
 
253 aa  300  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.06 
 
 
253 aa  295  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.98 
 
 
253 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.58 
 
 
255 aa  293  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.02 
 
 
253 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  54.66 
 
 
253 aa  292  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  54.18 
 
 
253 aa  292  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  51.6 
 
 
262 aa  291  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2230  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.76 
 
 
254 aa  290  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.97 
 
 
255 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  54.25 
 
 
253 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  51.6 
 
 
257 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.44 
 
 
284 aa  288  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  54.66 
 
 
257 aa  288  7e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  51.6 
 
 
257 aa  287  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.04 
 
 
253 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  51 
 
 
254 aa  286  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  53.85 
 
 
253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.63 
 
 
254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  51.98 
 
 
260 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  51.2 
 
 
266 aa  280  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.2 
 
 
257 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.6 
 
 
257 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
257 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  51.82 
 
 
262 aa  277  1e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.99 
 
 
257 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  52.99 
 
 
257 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.2 
 
 
264 aa  277  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  52.99 
 
 
251 aa  276  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  48.61 
 
 
255 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51 
 
 
256 aa  275  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.79 
 
 
470 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  50.8 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.4 
 
 
263 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52250  chromosome partition ParA  49.2 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4471  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.4 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0387085  hitchhiker  0.00000000187699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  48.61 
 
 
261 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  56.8 
 
 
262 aa  271  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  49 
 
 
263 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.99 
 
 
295 aa  271  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  49 
 
 
263 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49 
 
 
263 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
265 aa  271  8.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73350  chromosome partitioning protein Soj  50 
 
 
262 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.937828  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  50.79 
 
 
370 aa  271  8.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6365  chromosome partitioning protein Soj  50 
 
 
262 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.59 
 
 
336 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.4 
 
 
264 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.19 
 
 
437 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  49.24 
 
 
333 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 
433 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.6 
 
 
270 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  50 
 
 
330 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.8 
 
 
270 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.4 
 
 
257 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  49.24 
 
 
335 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.8 
 
 
255 aa  270  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0346  chromosome segregation ATPase  51.42 
 
 
253 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  49.24 
 
 
335 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  47.81 
 
 
255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.2 
 
 
277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4616  chromosome segregation ATPase  49.8 
 
 
262 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
264 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 
258 aa  269  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.6 
 
 
257 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49 
 
 
256 aa  268  5e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.71 
 
 
462 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  48.21 
 
 
256 aa  268  7e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 
274 aa  268  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.83 
 
 
392 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  48.61 
 
 
265 aa  267  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38000  chromosome segregation ATPase  47.21 
 
 
305 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.61 
 
 
265 aa  267  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.4 
 
 
263 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.41 
 
 
266 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 
257 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.62 
 
 
265 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.64 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  49.4 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  49.39 
 
 
276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  46.25 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3083  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.6 
 
 
264 aa  265  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0561465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>