More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0236 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0236  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  100 
 
 
451 aa  939    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2655  selenium metabolism protein SsnA  50.34 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1494  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  46.44 
 
 
445 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1672  selenium metabolism protein SsnA  45.86 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  47.64 
 
 
441 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0422  selenium metabolism protein SsnA  47.97 
 
 
450 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  43.15 
 
 
443 aa  352  5e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1427  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  41.93 
 
 
439 aa  349  6e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0458985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1629  amidohydrolase  36.01 
 
 
474 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0120  amidohydrolase  32.96 
 
 
426 aa  219  6e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4169  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  32.02 
 
 
442 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02712  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.73 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0813  selenium metabolism protein SsnA  31.73 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3205  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.8 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02674  hypothetical protein  31.73 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3039  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.73 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0829  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.73 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3012  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  31.58 
 
 
442 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  29.91 
 
 
432 aa  170  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  27.11 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3952  amidohydrolase  27.59 
 
 
422 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  30.02 
 
 
434 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  29.12 
 
 
431 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  29.36 
 
 
444 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.27 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1515  amidohydrolase  29.23 
 
 
429 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  28.34 
 
 
431 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  27.73 
 
 
431 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  29.19 
 
 
440 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  28.31 
 
 
434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  27.89 
 
 
432 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  25.38 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.31 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0754  amidohydrolase  30 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0991  amidohydrolase  29.48 
 
 
413 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  26.93 
 
 
433 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  27.79 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  27.9 
 
 
428 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2201  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.32 
 
 
441 aa  136  9e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.419012  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  26.58 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  26.82 
 
 
431 aa  133  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  28.21 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  29.48 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  26.61 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  25.89 
 
 
422 aa  130  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  25 
 
 
445 aa  130  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0145  amidohydrolase  28.96 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1851  amidohydrolase  28.5 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.91 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  27.44 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.91 
 
 
451 aa  127  5e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  25.42 
 
 
422 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2404  amidohydrolase  25.65 
 
 
432 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.378859  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  25.89 
 
 
422 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3416  amidohydrolase  32.31 
 
 
378 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.729562  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.6 
 
 
448 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1475  amidohydrolase domain-containing protein  27.99 
 
 
444 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0938308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1729  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.341763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1903  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1865  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.967163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  26.16 
 
 
663 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  26.13 
 
 
421 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 
440 aa  123  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1707  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1681  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00472799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1866  chlorohydrolase  25.74 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  25.42 
 
 
422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.56 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1721  chlorohydrolase  25.51 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1981  chlorohydrolase  25 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  26.77 
 
 
468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  24.94 
 
 
435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1951  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1460  chlorohydrolase  25.11 
 
 
435 aa  120  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00231906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1688  amidohydrolase  27.75 
 
 
440 aa  120  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.126758 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3476  chlorohydrolase  25.28 
 
 
435 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  27.03 
 
 
663 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  26.73 
 
 
656 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  23.76 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  26.68 
 
 
461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  25.11 
 
 
462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  30.33 
 
 
442 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  26.03 
 
 
442 aa  116  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  27.63 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.35 
 
 
470 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.35 
 
 
470 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.87 
 
 
493 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1229  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.72 
 
 
444 aa  113  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.42003e-16  normal  0.25554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.7 
 
 
470 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  24.89 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0559  chlorohydrolase family protein  27.44 
 
 
381 aa  113  8.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.7 
 
 
470 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  25.74 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  25.69 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.64 
 
 
470 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.41 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.85 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.41 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  25.06 
 
 
440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1531  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.53 
 
 
439 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>