50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0873 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  100 
 
 
152 aa  312  8e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  35 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  31.65 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.09 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  33.08 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  33.57 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  28.57 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  27.86 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  21.83 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.83 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  29.71 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  27.07 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.76 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.92 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  26.81 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.65 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.06 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  31.68 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  25.53 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  24.63 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.32 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  32.41 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  27.07 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.09 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  23.31 
 
 
143 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  25.9 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  25.9 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  29.7 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.81 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  23.74 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  27.07 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.09 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  26.09 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  22.56 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  23.91 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  24.06 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.07 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  24.79 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  23.31 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  27.07 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  27.34 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  23.31 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  25.4 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  25.55 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  23.31 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  24.63 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  23.48 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  28.95 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.28 
 
 
143 aa  43.9  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  26.26 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>