137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4234 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4234  methyltransferase  100 
 
 
298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2708  methyltransferase  58.57 
 
 
301 aa  318  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4761  methyltransferase  61.09 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.991548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3327  methyltransferase  44.76 
 
 
278 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103507  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1018  methyltransferase  39.3 
 
 
312 aa  149  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.514126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10912  hypothetical protein  44.08 
 
 
325 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13434  hypothetical protein  37.77 
 
 
348 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0369  hypothetical protein  45.97 
 
 
300 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0379  putative methyltransferase  45.97 
 
 
300 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  0.5455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0358  putative methyltransferase  45.97 
 
 
300 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0088  hypothetical protein  38.89 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0097  putative methyltransferase  38.89 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0973562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11746  hypothetical protein  35.88 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.399672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5024  putative methyltransferase  39.78 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199097  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4929  putative methyltransferase  48.22 
 
 
283 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal  0.0723048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0078  putative methyltransferase  39.51 
 
 
312 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809042  normal  0.434766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5025  putative methyltransferase  36.6 
 
 
307 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.056649  normal  0.20395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11925  hypothetical protein  37.32 
 
 
303 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.728522  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7735  protein of unknown function Mtu_121  41.39 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10288  hypothetical protein  37.93 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.59683e-26  normal  0.455495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1344  putative methyltransferase  35.83 
 
 
305 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514876  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1043  hypothetical protein  35.27 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1059  putative methyltransferase  35.27 
 
 
304 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.769331  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1071  putative methyltransferase  36.03 
 
 
304 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10845  hypothetical protein  43 
 
 
301 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203136  hitchhiker  0.000000140012 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0933  putative methyltransferase  38.1 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3841  methyltransferase  40 
 
 
305 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0743  putative methyltransferase  37.8 
 
 
309 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10146  hypothetical protein  41.07 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10745  hypothetical protein  36.26 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.397623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5023  putative methyltransferase  37.6 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.388  normal  0.30884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0910  putative methyltransferase  41.41 
 
 
295 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1345  putative methyltransferase  36.65 
 
 
306 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1072  putative methyltransferase  36.43 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1044  hypothetical protein  36.06 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491242  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1060  putative methyltransferase  36.06 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10740  hypothetical protein  34.56 
 
 
367 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.508563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1045  hypothetical protein  34.55 
 
 
308 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1061  putative methyltransferase  34.55 
 
 
308 aa  125  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10147  hypothetical protein  39.06 
 
 
310 aa  125  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0104  putative methyltransferase  40.69 
 
 
309 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1073  putative methyltransferase  34.55 
 
 
308 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1346  putative methyltransferase  38.79 
 
 
310 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13821  hypothetical protein  37.23 
 
 
308 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13799  hypothetical protein  33.77 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.224674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10739  hypothetical protein  40.64 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.195713  normal  0.904261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1573  protein of unknown function Mtu_121  35.29 
 
 
279 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894053  normal  0.0567385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0079  putative methyltransferase  46.76 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.331361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3182  methyltransferase  40.75 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0089  hypothetical protein  46.04 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0098  putative methyltransferase  46.04 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.154609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  41.4 
 
 
798 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0879  hypothetical protein  33.11 
 
 
329 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.967499  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0168  putative methyltransferase  37.44 
 
 
246 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.627272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0592  putative methyltransferase  38.97 
 
 
249 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0567855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0570  putative methyltransferase  38.97 
 
 
249 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0580  hypothetical protein  38.97 
 
 
242 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2358  methyltransferase  33.96 
 
 
291 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.341035  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0738  putative methyltransferase  32.29 
 
 
245 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5616  methyltransferase  37 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1545  putative methyltransferase  31.71 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3683  hypothetical protein  36 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4684  putative methyltransferase  36 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0882703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3751  methyltransferase  34.65 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0904683  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4828  methyltransferase  34.65 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0123  hypothetical protein  27.96 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000106694  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1136  protein of unknown function Mtu_121  35.68 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200581  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4542  methyltransferase  34.26 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.165839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2741  hypothetical protein  27.23 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.321866  hitchhiker  0.000409678 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1696  hypothetical protein  32.21 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.152352 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30355  predicted protein  37.66 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3295  hypothetical protein  29.38 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1105  methyltransferase  31.88 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0581586  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4078  putative methyltransferase  33.82 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.657196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3713  methyltransferase  34.32 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3289  hypothetical protein  30.29 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6184  methyltransferase  34.57 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0483  methyltransferase  38.06 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00128266  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1821  putative methyltransferase  29.57 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.135863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3549  putative methyltransferase  34.71 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4307  hypothetical protein  30.96 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4009  methyltransferase  35.53 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0764257  normal  0.338849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3293  hypothetical protein  28.34 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.779586 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0022  hypothetical protein  35.11 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1091  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0738969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2540  methyltransferase  34.25 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.266861  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0944  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3294  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.814215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0354  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0437  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0209  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1892  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1396  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.474501  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3964  methyltransferase  33.33 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0986536  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1806  hypothetical protein  37.04 
 
 
286 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2748  methyltransferase  35.15 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2654  methyltransferase  38.52 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340781  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1213  protein of unknown function Mtu_121  37.78 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311438  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0683  methyltransferase  33.69 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1545  putative methyltransferase  32.31 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.499982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>