16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2881 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2881  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3874  hypothetical protein  40.62 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172055  normal  0.0781303 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2770  metallophosphoesterase  60.71 
 
 
808 aa  163  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0261608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2764  hypothetical protein  51.88 
 
 
543 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.671405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4775  hypothetical protein  40.26 
 
 
492 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0542528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0091  putative esterase  35.64 
 
 
882 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  31.85 
 
 
631 aa  72.8  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2623  hypothetical protein  44.35 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0452  NHL repeat-containing protein  36.36 
 
 
525 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01070  hypothetical protein  36.76 
 
 
215 aa  67  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.65358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2380  hypothetical protein  31.62 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2030  hypothetical protein  41.96 
 
 
486 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.178771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2763  hypothetical protein  35.33 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2379  hypothetical protein  36.24 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.262289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  30.77 
 
 
615 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3875  hypothetical protein  32.51 
 
 
426 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  0.0255887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>