57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1706 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  100 
 
 		 513 aa  998    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  58.93 
 
 		 397 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  52.83 
 
 		 599 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  44.47 
 
 		 436 aa  282  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  47.06 
 
 		 449 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  47.57 
 
 		 448 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  36.14 
 
 		 406 aa  237  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  39.45 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  38.28 
 
 		 499 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  38.42 
 
 		 422 aa  228  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  38.76 
 
 		 484 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  35.97 
 
 		 484 aa  226  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  43.75 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  37.29 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  46.15 
 
 		 438 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  39.36 
 
 		 404 aa  200  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  36.88 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  39.89 
 
 		 447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  45.81 
 
 		 480 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  37.47 
 
 		 413 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  40.77 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  44.78 
 
 		 416 aa  193  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  36.98 
 
 		 404 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  38.56 
 
 		 410 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  38.31 
 
 		 424 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  38.31 
 
 		 424 aa  174  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  40.67 
 
 		 446 aa  167  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  32.59 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  42.8 
 
 		 345 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  28.21 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  31.58 
 
 		 392 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  33.86 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  32.74 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  29.57 
 
 		 373 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  28.4 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  34.36 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  25.68 
 
 		 396 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  27.43 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  31.76 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  28.24 
 
 		 370 aa  108  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  26.44 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  26.61 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.94 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.94 
 
 		 260 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  26.56 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  30.58 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  29.32 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  28.18 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.59 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.95 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  24.41 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  24.41 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  34.4 
 
 		 361 aa  69.7  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  24.34 
 
 		 371 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  23.85 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  23.53 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  27.27 
 
 		 365 aa  43.9  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>