18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0073 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  403  1e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3277  hypothetical protein  46.28 
 
 
193 aa  146  2e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  31.06 
 
 
191 aa  53.5  2e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  30.52 
 
 
171 aa  52.4  4e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  31.61 
 
 
191 aa  52  6e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.44588e-06  unclonable  1.52413e-07 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  31.61 
 
 
191 aa  52  6e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  32.58 
 
 
191 aa  50.4  2e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  28.57 
 
 
189 aa  49.7  3e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  27.43 
 
 
191 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  49.3  4e-05  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  25.67 
 
 
194 aa  48.1  9e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  31.91 
 
 
200 aa  48.1  9e-05  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  29.28 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  27.33 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  33.09 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  26.63 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  28 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  28.48 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>