36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0221 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0221  peptidase S51 dipeptidase E  100 
 
 		 229 aa  442  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2188  cyanophycinase  25.64 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2478  cyanophycinase  25.64 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2775  cyanophycinase  32.42 
 
 		 611 aa  72  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0986  cyanophycinase  29.25 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00665374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4853  cyanophycinase  29.17 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0959  cyanophycinase  29.25 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1639  peptidase S51 dipeptidase E  32.89 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0874  cyanophycinase  28.9 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0084  cyanophycinase  29.77 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5801  cyanophycinase  29.41 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1964  cyanophycinase  26.99 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0630267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1813  cyanophycinase  28.73 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0131  cyanophycinase  23.96 
 
 		 274 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0054  cyanophycinase  26.41 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1177  cyanophycinase  27.88 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0337  cyanophycinase. Serine peptidase. MEROPS family S51  27.31 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.504841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2205  cyanophycinase  24.2 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0616  cyanophycinase  28.79 
 
 		 293 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0275965  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1870  cyanophycinase  24.87 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.989428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1113  cyanophycinase  27.35 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.481233  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1351  cyanophycinase  25.57 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4859  cyanophycinase  29.49 
 
 		 327 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.600302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4154  cyanophycinase  29.26 
 
 		 279 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2399  cyanophycinase  24.24 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2731  cyanophycinase  26.94 
 
 		 295 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0218  peptidase S51 dipeptidase E  21.23 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.912522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13540  cyanophycinase  29.17 
 
 		 328 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.500388  normal  0.709698 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07320  peptidase E  22.28 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1651  cyanophycinase  26 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2878  cyanophycinase-related exopeptidase  31.36 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1900  cyanophycinase-like protein  25.32 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147675  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0081  peptidase E  26.81 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1621  peptidase S51 dipeptidase E  27.72 
 
 		 317 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.468435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2052  cysteinyl-tRNA synthetase-like  29.05 
 
 		 431 aa  42  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1040  S51 family peptidase  25.48 
 
 		 206 aa  42  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.388382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>