35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0203 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  704    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  56.56 
 
 
361 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  50.73 
 
 
354 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  47.69 
 
 
355 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  42.69 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  39.13 
 
 
355 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  37.54 
 
 
356 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  36.47 
 
 
343 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  33.24 
 
 
356 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  35.41 
 
 
342 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  35.69 
 
 
342 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  32.42 
 
 
346 aa  142  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  29.34 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1610  hypothetical protein  29.14 
 
 
342 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.589994  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  31.18 
 
 
358 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1397  hypothetical protein  27.64 
 
 
341 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00537849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1905  hypothetical protein  28.88 
 
 
341 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000983777  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0486  hypothetical protein  26.93 
 
 
346 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0157  hypothetical protein  25.74 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.050651  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3561  hypothetical protein  25.82 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  26.57 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  25.89 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.85 
 
 
339 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.85 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  24.57 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  26.92 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  23.84 
 
 
335 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.79 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2350  hypothetical protein  25.7 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.78 
 
 
362 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.13 
 
 
337 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1722  hypothetical protein  30.86 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135438  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  24.49 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  27.01 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  24.55 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>