288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0072 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
162 aa  334  3e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  65.97 
 
 
151 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  65.97 
 
 
151 aa  209  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  61.49 
 
 
156 aa  204  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.65345e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.78 
 
 
148 aa  203  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.56 
 
 
147 aa  202  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  64.58 
 
 
154 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.89213e-08  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  63.89 
 
 
154 aa  201  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 
154 aa  199  2e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  61.74 
 
 
159 aa  197  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.69 
 
 
161 aa  196  8e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  58.11 
 
 
158 aa  196  1e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.03 
 
 
152 aa  196  1e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.38 
 
 
149 aa  196  1e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.07 
 
 
155 aa  195  2e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  1.04146e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.31 
 
 
153 aa  194  4e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.42 
 
 
156 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  61.7 
 
 
156 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.28 
 
 
151 aa  191  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  2.30584e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.99 
 
 
155 aa  191  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.36796e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.56 
 
 
158 aa  190  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.45 
 
 
145 aa  189  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  59.86 
 
 
155 aa  189  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  60.28 
 
 
156 aa  189  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.11 
 
 
153 aa  189  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.7 
 
 
155 aa  187  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.16 
 
 
182 aa  185  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.41 
 
 
144 aa  183  1e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.57 
 
 
176 aa  182  1e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  56.03 
 
 
170 aa  182  1e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.27 
 
 
153 aa  180  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  60.43 
 
 
159 aa  180  7e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.03 
 
 
157 aa  178  3e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  56.03 
 
 
157 aa  178  3e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 
169 aa  177  5e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.32 
 
 
157 aa  177  5e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.42 
 
 
169 aa  177  5e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.85737e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.04 
 
 
149 aa  177  6e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.65 
 
 
170 aa  172  1e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.52 
 
 
169 aa  172  2e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  53.52 
 
 
157 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.32 
 
 
151 aa  142  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.94 
 
 
200 aa  129  2e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.58 
 
 
173 aa  129  2e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  46.15 
 
 
185 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.89 
 
 
174 aa  127  5e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  43.54 
 
 
153 aa  127  7e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  43.36 
 
 
158 aa  127  8e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.48 
 
 
174 aa  126  1e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  125  2e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.77 
 
 
174 aa  124  4e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  43.71 
 
 
151 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04329e-06 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  45.77 
 
 
156 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  45.45 
 
 
185 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  45.07 
 
 
187 aa  124  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  44.97 
 
 
154 aa  124  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.29271e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  44.76 
 
 
185 aa  122  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.07 
 
 
177 aa  122  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  43.66 
 
 
173 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  44.76 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  1.27363e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  44.06 
 
 
185 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  44 
 
 
165 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  42.86 
 
 
161 aa  122  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.70948e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  45.39 
 
 
164 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.39 
 
 
164 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.39 
 
 
164 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.1 
 
 
164 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
143 aa  120  1e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
143 aa  120  1e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  40.82 
 
 
341 aa  119  2e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  41.96 
 
 
162 aa  119  2e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.29 
 
 
150 aa  117  5e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.37 
 
 
153 aa  116  1e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.96 
 
 
167 aa  116  1e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  44.93 
 
 
146 aa  116  2e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  43.57 
 
 
151 aa  113  1e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  6.12083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 
135 aa  112  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.52 
 
 
186 aa  112  2e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  40.65 
 
 
273 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1068  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.85 
 
 
164 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.223544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0885  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.11 
 
 
173 aa  104  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0241026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.85 
 
 
158 aa  104  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0131735  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  40.16 
 
 
159 aa  103  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0189  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
162 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  39.35 
 
 
160 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.48 
 
 
168 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.46 
 
 
148 aa  101  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf406  deoxycytidylate deaminase  38.76 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.35 
 
 
145 aa  100  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.29 
 
 
143 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.77 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.45 
 
 
179 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.04 
 
 
150 aa  97.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0627  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.31 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.8 
 
 
180 aa  95.5  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>