116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0016 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  100 
 
 
85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  39.76 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  45.83 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  49.15 
 
 
77 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  39.51 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  42.47 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  48.21 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  40.45 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  40.45 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  37.35 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  44.71 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  51.72 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  47.46 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  44.64 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  41.1 
 
 
73 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  41.18 
 
 
60 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  45 
 
 
71 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  35.37 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  38.27 
 
 
79 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0015  twin arginine-targeting protein translocase  67.31 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  46.43 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  47.92 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 
76 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  40 
 
 
79 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  43.08 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  40.38 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1773  twin-arginine translocation protein TatA/E  39.68 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  35.09 
 
 
87 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  32.91 
 
 
82 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  45.31 
 
 
77 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  39.22 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  42.59 
 
 
73 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  44.44 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  37.93 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.78 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  39.29 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1023  twin arginine-targeting protein translocase  40 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  48.57 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  39.58 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  41.67 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  42.86 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  35.59 
 
 
83 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  32.94 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  34.72 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  34.57 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3930  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  38.18 
 
 
55 aa  43.9  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  32.14 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  39.74 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  51.35 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  35.44 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  36.07 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.35 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  32.1 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  34.33 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  33.33 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  42.86 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.37 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2345  twin arginine translocase protein A  55.77 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  35.37 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>