18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3956 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3956  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6907  hypothetical protein  31.17 
 
 
262 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.364037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3871  hypothetical protein  33.76 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3784  hypothetical protein  31.58 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.575497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5103  hypothetical protein  29.32 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3180  hypothetical protein  31.2 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3587  hypothetical protein  31.51 
 
 
241 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1423  hypothetical protein  28.23 
 
 
284 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1469  hypothetical protein  28.23 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1702  hypothetical protein  26.95 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00453742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2419  hypothetical protein  27.88 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147203  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0937  hypothetical protein  26.36 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306753  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5034  hypothetical protein  25.1 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1532  hypothetical protein  26.41 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0272744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2479  hypothetical protein  23.05 
 
 
445 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000256372  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3031  hypothetical protein  24.05 
 
 
251 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.207128  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2635  hypothetical protein  25.69 
 
 
319 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.406552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3828  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.92 
 
 
785 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>