69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2821 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2821  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 
289 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00171982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3126  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  64.98 
 
 
307 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1776  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  51.04 
 
 
245 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.324205  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2795  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  49.6 
 
 
246 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.048407  hitchhiker  0.00112635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2078  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  48.18 
 
 
238 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00880  hypothetical protein  42.74 
 
 
251 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09950  hypothetical protein  44.83 
 
 
249 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
515 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28310  hypothetical protein  43.62 
 
 
306 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  40.43 
 
 
250 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1626  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
531 aa  132  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.44 
 
 
230 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1324  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  46 
 
 
275 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215746  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  40.53 
 
 
255 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2179  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.33 
 
 
230 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  decreased coverage  0.000000457043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.17 
 
 
246 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1615  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.43 
 
 
248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.61 
 
 
255 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10263  hypothetical protein  33.89 
 
 
247 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.826629  normal  0.120754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.48 
 
 
244 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.78 
 
 
234 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1812  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.77 
 
 
249 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.27 
 
 
258 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.2 
 
 
238 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0262  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.61 
 
 
231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0272  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.61 
 
 
231 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.243812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0841  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  36.51 
 
 
252 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000619723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0252  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  37.16 
 
 
231 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  33.73 
 
 
281 aa  99  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  38.91 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6698  sirohydrochlorin cobaltochelatase  37.61 
 
 
253 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99079  normal  0.371849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.8 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0381  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.59 
 
 
252 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00853901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1128  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.74 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.88 
 
 
234 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.47 
 
 
234 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2348  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.2 
 
 
247 aa  86.3  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.47 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  33.47 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.73 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4082  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.32 
 
 
250 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4371  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.37 
 
 
241 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1231  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.95 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12790  hypothetical protein  31.78 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3702  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.63 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.512385  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.27 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2699  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.68 
 
 
550 aa  60.1  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2804  hitchhiker  0.000140912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0646  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.34 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4163  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.11 
 
 
357 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108946  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2430  hypothetical protein  29.27 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1967  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203988  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2174  cbiX domain protein  24.86 
 
 
236 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6031  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.06 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321792  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1946  hypothetical protein  25.19 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2290  cbiX domain protein  23.78 
 
 
236 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1023  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  25.13 
 
 
309 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4925  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.21 
 
 
127 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2149  cbiX domain protein  23.78 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1271  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.78 
 
 
465 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2143  CbiX domain-containing protein  23.7 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.458667  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1994  CbiX domain-containing protein  23.7 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1131  hypothetical protein  30.83 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.470289  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1722  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.44 
 
 
127 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3470  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.05 
 
 
408 aa  43.9  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0988  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  26.49 
 
 
410 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3165  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.28 
 
 
134 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232194  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0297  hypothetical protein  28.8 
 
 
225 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.625672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2563  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  28.02 
 
 
304 aa  42.7  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.523631  normal  0.848204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3165  cbiX domain protein  24.26 
 
 
236 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>