25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2062 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  45.08 
 
 		 201 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  42.71 
 
 		 209 aa  155  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  43.2 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  38.27 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  40.59 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  38.5 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  36.73 
 
 		 218 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  31.76 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  28.14 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  29.24 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  29.34 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  30.67 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 186 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  28.29 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  26.83 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  36.11 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  42.31 
 
 		 903 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 		 256 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>