22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1693 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1693  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00150047  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1391  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  589  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1295  hypothetical protein  45.39 
 
 
281 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4188  hypothetical protein  46.15 
 
 
283 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2259  hypothetical protein  39.49 
 
 
299 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300897  normal  0.797835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0274  hypothetical protein  39.93 
 
 
328 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.491507  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4189  hypothetical protein  38.89 
 
 
300 aa  182  5e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.778926  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1098  hypothetical protein  40.07 
 
 
303 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.193091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1265  hypothetical protein  41.11 
 
 
298 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.486985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0273  hypothetical protein  37.59 
 
 
336 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.747748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4156  hypothetical protein  38.2 
 
 
283 aa  173  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2448  hypothetical protein  37.09 
 
 
319 aa  164  1e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2252  hypothetical protein  37.64 
 
 
296 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1946  hypothetical protein  33.81 
 
 
299 aa  147  2e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.880303  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4200  hypothetical protein  34.77 
 
 
295 aa  145  8e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104599  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4610  hypothetical protein  31.97 
 
 
314 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4515  hypothetical protein  31.78 
 
 
283 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.150515  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4207  hypothetical protein  29 
 
 
280 aa  112  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10293  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
453 aa  98.6  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01187  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0088  hypothetical protein  20.86 
 
 
217 aa  59.7  5e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01835  hypothetical protein  26.76 
 
 
428 aa  59.7  5e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>