28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Arg-4 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 
82 bp  163  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5228  tRNA-Arg  100 
 
 
81 bp  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5826  tRNA-Arg  100 
 
 
81 bp  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5292  tRNA-Arg  100 
 
 
81 bp  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5733  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  100 
 
 
79 bp  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0148  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5695  tRNA-Arg  98.75 
 
 
81 bp  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0144  tRNA-Arg  97.47 
 
 
79 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0004  tRNA-Arg  96.55 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0200827  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0026  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.863353  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0012  tRNA-Ile  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal  0.0165224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0016  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.228908 
 
 
-
 
NC_003295  RS05228  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0079  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.45343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318513  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0002  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0106589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>