20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2338 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  43.82 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  39.92 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  43.23 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  41.37 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  33.99 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  33.07 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  35.8 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  37.45 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  33.86 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.99 
 
 		 748 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.9 
 
 		 748 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  29.29 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.8 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.420259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.17 
 
 		 745 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1441  hypothetical protein  34 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00299973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0992  hypothetical protein  32.38 
 
 		 180 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000454439  unclonable  0.00000572883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0498  hypothetical protein  31.67 
 
 		 192 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1137  hypothetical protein  31.67 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.71 
 
 		 739 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>