11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2467 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  63.49 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  40.73 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  37.39 
 
 		 253 aa  154  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  38.59 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  33.47 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  37.66 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  36.51 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  39.07 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  40.42 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  27.18 
 
 		 192 aa  43.5  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>