16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1145 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  385  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1441  hypothetical protein  59.04 
 
 
208 aa  240  7.999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00299973  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0992  hypothetical protein  57.81 
 
 
180 aa  235  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000454439  unclonable  0.00000572883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0498  hypothetical protein  42.05 
 
 
192 aa  164  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1137  hypothetical protein  41.03 
 
 
192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  29.29 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.14 
 
 
748 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  31.17 
 
 
252 aa  48.5  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  25.96 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.14 
 
 
740 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0265662  normal  0.894509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 
745 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 
748 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  33.71 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  28.24 
 
 
231 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  33.71 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.92 
 
 
304 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.420259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>