16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1086 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  61.28 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  63.4 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  31.75 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  33.99 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  35.74 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  34.76 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  35.75 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  37.08 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  34.57 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1441  hypothetical protein  27.88 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00299973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  28.24 
 
 		 192 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 		 745 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 		 748 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.61 
 
 		 739 aa  42  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.29 
 
 		 748 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>