13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0194 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  64.68 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  63.4 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  41.13 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  37.29 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  37.85 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  33.73 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  37.05 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  40.42 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  37.95 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.23 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.420259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.87 
 
 		 745 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>