20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00341 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00341  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2338  hypothetical protein  39.92 
 
 		 253 aa  181  7e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6651  hypothetical protein  36.05 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0202  hypothetical protein  36.9 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6897  hypothetical protein  37.94 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1086  hypothetical protein  33.04 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0092  hypothetical protein  32.54 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.237058 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0194  hypothetical protein  33.73 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2467  hypothetical protein  33.47 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.424462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2335  hypothetical protein  31.62 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2852  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.74 
 
 		 748 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0132054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1145  hypothetical protein  31.17 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5160  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.72 
 
 		 739 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.8765  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.91 
 
 		 304 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.420259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2758  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.03 
 
 		 745 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1441  hypothetical protein  25.47 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00299973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2646  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25 
 
 		 740 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0265662  normal  0.894509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1137  hypothetical protein  28.97 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2667  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  20.37 
 
 		 748 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0992  hypothetical protein  24.75 
 
 		 180 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000454439  unclonable  0.00000572883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>