299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lplr03 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lppr03  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr03  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  250  7e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr06  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppr07  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr06  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplr07  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 126 bp  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0039  5S ribosomal RNA  87.36 
 
 		 115 bp  85.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00326  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06827  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03717  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0060  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 118 bp  75.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.873791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  85.11 
 
 		 120 bp  75.8  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0018  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 118 bp  75.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0065  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 118 bp  75.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0055  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 118 bp  75.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00000502175 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0070  5S ribosomal RNA  90.32 
 
 		 118 bp  75.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00193  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00247  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00472  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00374  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00199  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03612  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01013  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 117 bp  75.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2547  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2712  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000024444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2325  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 123 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2071  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 124 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  84.78 
 
 		 115 bp  71.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0246  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2456  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 124 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2334  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 124 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000925408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2805  5S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 121 bp  71.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  89.83 
 
 		 115 bp  69.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0152  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000035078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0619749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 121 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 120 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0023  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.7425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0048  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.926696  normal  0.0497776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0056  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0061  5S ribosomal RNA  88.71 
 
 		 114 bp  67.9  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0159471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0004  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 122 bp  67.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.73386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 120 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 115 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  84.04 
 
 		 116 bp  67.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1115r  5S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 120 bp  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2069a  5S ribosomal RNA  82.3 
 
 		 124 bp  65.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SB  5S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000511207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SE  5S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.110384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5SF  5S ribosomal RNA  83.7 
 
 		 120 bp  63.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0070  5S ribosomal RNA  95 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>