298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2712 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2805  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.143607  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2712  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000024444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2547  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 121 bp  240  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2456  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 		 124 bp  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0246  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 		 121 bp  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2071  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 		 124 bp  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2325  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 		 123 bp  232  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2334  5S ribosomal RNA  99.17 
 
 		 124 bp  230  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000925408  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna091  5S ribosomal RNA  95.87 
 
 		 121 bp  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.010484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna060  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna046  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna082  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna089  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna010  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna054  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000122961  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2069a  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 124 bp  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna154  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna035  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna042  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna077  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000940353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna023  5S ribosomal RNA  95.04 
 
 		 121 bp  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3210r  5S ribosomal RNA  93.39 
 
 		 121 bp  176  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3182r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.175468  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3091r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3139r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3109r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0264558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3073r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000752328  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3084r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000384102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3094r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3186r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.713865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3114r  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 		 120 bp  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03610  5S ribosomal RNA  94.83 
 
 		 117 bp  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1115r  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 120 bp  167  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.155986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3078r  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 120 bp  167  8e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000647094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00193  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01013  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00326  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00199  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00247  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00472  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03612  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03717  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00374  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06827  5S ribosomal RNA  93.16 
 
 		 117 bp  161  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3096r  5S ribosomal RNA  92.04 
 
 		 121 bp  153  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0118  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0128  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.875771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0132  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000272918  normal  0.0785427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0138  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0141  5S ribosomal RNA  88.79 
 
 		 120 bp  127  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_r003  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r006  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r009  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r010  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r013  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r016  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r022  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_r025  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 120 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 115 bp  125  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  88.7 
 
 		 121 bp  125  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0003  5S ribosomal RNA  88.6 
 
 		 120 bp  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95198  hitchhiker  0.000000732867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0018  5S ribosomal RNA  88.6 
 
 		 120 bp  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0073  5S ribosomal RNA  88.6 
 
 		 120 bp  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.568148  normal  0.279617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0023  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0011  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0219912  normal  0.295401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0018  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000474552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0075  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0121  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.777724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0130  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0134  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00025818  hitchhiker  0.00693749 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0138  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0141  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0003  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377147  hitchhiker  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0011  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0018  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.374169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0024  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000358593  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0028  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0075  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.110925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0121  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0139  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0142  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 113 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0017  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  88.5 
 
 		 116 bp  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>