31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2186 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  363  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  98.84 
 
 
172 aa  358  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  64.53 
 
 
172 aa  247  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  56.07 
 
 
175 aa  209  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  43.9 
 
 
160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  45.03 
 
 
148 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  42.42 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  43.29 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  41.46 
 
 
160 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  41.83 
 
 
156 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  40.85 
 
 
152 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  47.52 
 
 
139 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  37.97 
 
 
177 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  40.12 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2066  hypothetical protein  97.92 
 
 
48 aa  100  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000783821  hitchhiker  0.0000854583 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  35.15 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  37.32 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  47.5 
 
 
84 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  43.75 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3003  hypothetical protein  40.23 
 
 
107 aa  57  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005866  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  50.98 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  33.87 
 
 
535 aa  40.8  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>