30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2388 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  62.2 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  61.25 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  52.5 
 
 		 172 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  48.15 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  48.15 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  45 
 
 		 160 aa  83.6  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  47.5 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  47.5 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  41.98 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  47.5 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  40 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  44.3 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  40.24 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  36.59 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  38.03 
 
 		 1427 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  57.58 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1283  hypothetical protein  42.86 
 
 		 49 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.191456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>