39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1282 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0564  hypothetical protein  96.51 
 
 
86 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1529  hypothetical protein  96.51 
 
 
86 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.755906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1306  hypothetical protein  96.51 
 
 
86 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1499  hypothetical protein  87.72 
 
 
86 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207851  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  90.7 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  90.7 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  90.7 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  90.7 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  90.7 
 
 
160 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  90.7 
 
 
156 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  88.37 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  70 
 
 
139 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  65 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  44.44 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  61.54 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  61.54 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  58.97 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  57.14 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  37.93 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  54.76 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  53.66 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  58.82 
 
 
90 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0136  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.605247  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0336  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  48.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0641908  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2262  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2337  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2316  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2822  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  52.38 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  54.05 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1325  hypothetical protein  33.85 
 
 
91 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.624039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  46.34 
 
 
138 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  45 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>