30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2888 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2888  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  312  9e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.70443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1324  hypothetical protein  45.57 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0100  hypothetical protein  42.58 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0130  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2338  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0918492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2317  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0137  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2821  hypothetical protein  44.59 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.338668  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0337  hypothetical protein  43.95 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.043628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1530  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1500  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0589  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.920476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0563  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1307  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0794  hypothetical protein  40.76 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.475725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2186  hypothetical protein  40.85 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3339  hypothetical protein  46.72 
 
 		 148 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595806  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1633  hypothetical protein  43.28 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1675  hypothetical protein  42.5 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2298  hypothetical protein  43.05 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2388  hypothetical protein  61.25 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1247  hypothetical protein  40.74 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2983  hypothetical protein  41.61 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00581443  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5374  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303606  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0742  hypothetical protein  40.24 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.672077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0026  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.434634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1238  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.35146  normal  0.290889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3003  hypothetical protein  35 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1282  hypothetical protein  54.05 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.250651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  45.45 
 
 		 535 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>