26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1879 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1879  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0596  hypothetical protein  69.49 
 
 		 183 aa  264  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0766  hypothetical protein  37.66 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0851  hypothetical protein  37.66 
 
 		 162 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4729  inner membrane protein YagU  34.21 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4667  inner membrane protein YagU  35.1 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4657  inner membrane protein YagU  35.1 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0105  periplasmic/secreted protein  32.26 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000252803  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1319  S-adenosylmethionine synthetase  28.75 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3212  protein of unknown function DUF1440  30.68 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.269877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3478  protein of unknown function DUF1440  28.47 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3317  protein of unknown function DUF1440  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00249  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0333  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0313  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0362655  hitchhiker  0.00720742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3332  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0298  hypothetical protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2282  hypothetical protein  29.61 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00246  conserved inner membrane protein  30.68 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0429  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0508  protein of unknown function DUF1440  29.55 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1474  hypothetical protein  28.89 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0171  hypothetical protein  26.42 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0166  hypothetical protein  26.42 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0487  periplasmic/secreted protein  28.1 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0671981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1743  periplasmic/secreted protein  27.85 
 
 		 167 aa  47.8  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>