31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0429 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0429  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0508  protein of unknown function DUF1440  97.06 
 
 		 204 aa  407  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3317  protein of unknown function DUF1440  88.24 
 
 		 204 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00249  hypothetical protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0333  hypothetical protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.787826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0313  hypothetical protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0362655  hitchhiker  0.00720742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3332  hypothetical protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0298  hypothetical protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00246  conserved inner membrane protein  88.73 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3212  protein of unknown function DUF1440  87.13 
 
 		 204 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.269877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2282  hypothetical protein  86.63 
 
 		 208 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1474  hypothetical protein  71.81 
 
 		 198 aa  275  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4657  inner membrane protein YagU  57.71 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4667  inner membrane protein YagU  57.71 
 
 		 185 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1888  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4729  inner membrane protein YagU  56.35 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1319  S-adenosylmethionine synthetase  41.67 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0851  hypothetical protein  38.04 
 
 		 162 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0766  hypothetical protein  37.02 
 
 		 164 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3478  protein of unknown function DUF1440  35.67 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0166  hypothetical protein  29.28 
 
 		 164 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0171  hypothetical protein  29.28 
 
 		 164 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0911  hypothetical protein  32.2 
 
 		 166 aa  88.2  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0105  periplasmic/secreted protein  33.33 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1837  periplasmic/secreted protein  33.52 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000159853  normal  0.231826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0463  hypothetical protein  32.8 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00263232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0487  periplasmic/secreted protein  30.65 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0671981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0596  hypothetical protein  31.4 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1743  periplasmic/secreted protein  30.12 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1879  hypothetical protein  31.61 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140276 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0040  inner membrane protein YagU  52.17 
 
 		 49 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106112  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0041  membrane protein, putative, degenerate  57.14 
 
 		 93 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>